Особенности строения первичных дегидрогеназ в окисленной и восстановленной формах заключаются в изменениях в структуре кофермента НАД. 25
В окисленной форме пиридиновое кольцо никотинамида имеет положительный заряд у четвертичного атома азота (поэтому окисленную форму НАД записывают в виде НАД+). 5 Это вызывает смещение электронной плотности в пиридиновом кольце и появление положительного заряда у атома углерода в параположении. 5 К нему присоединяется гидрид-ион (Н-), образующийся при неравномерном распределении электронов между атомами водорода. 5 Другой атом водорода, потерявший электрон (Н+), освобождается в окружающую среду, подкисляя её. 5 В результате образуется восстановленная форма НАД, записываемая в виде НАД.2Н или НАД.Н+Н+. 5
Окисленная форма НАД прочно удерживает белок, но при восстановлении НАДа связь с белком теряется: апофермент связывается с другой молекулой окисленного НАДа. 2