Ключевые различия между активными центрами аллостерических и неаллостерических ферментов заключаются в наличии и функции аллостерического центра. 13

У неаллостерических ферментов активный центр выполняет только каталитическую функцию, обеспечивая взаимодействие с субстратом. 13 В нём условно можно выделить субстратсвязывающий участок (контактную площадку) и собственно каталитический центр, который вступает в химическое взаимодействие с субстратом. 3

У аллостерических ферментов помимо активного центра, в молекуле фермента может присутствовать также аллостерический центр, который находится за его пределами. 3 К аллостерическому центру могут присоединяться молекулы модуляторов (активаторов или ингибиторов), регулирующие активность фермента. 3 Присоединение модулятора к аллостерическому центру изменяет конфигурацию молекулы фермента и, соответственно, конфигурацию активного центра, вызывая повышение или снижение активности фермента. 3