Теория Бора не применима для многоэлектронных атомов, потому что модель не предсказывает энергетические уровни таких атомов. 3
Это связано с тем, что электроны в многоэлектронных атомах не только подвергаются воздействию ядра, но и взаимодействуют друг с другом посредством кулоновской силы. 3 В теории Бора же электроны могут двигаться только по определённым (стационарным) орбитам, находясь на которых они не излучают энергию, а излучение или поглощение происходит только в момент перехода с одной орбиты на другую. 3
Кроме того, в те времена, когда разрабатывалась теория Бора, были неизвестны два принципа построения сложных атомов: принцип запрета Паули и существование у электрона спина. 1