Существует два способа подачи декларации по НДС в электронном виде: 1

1. Прямой. 1 Организация-налогоплательщик самостоятельно заключает договор с оператором электронного документооборота (ЭДО). 1 Ему предоставляется программа для отправки отчётности, а на руководителя или другое уполномоченное лицо оформляется электронная цифровая подпись. 1 Также существуют облачные сервисы, когда программное обеспечение предоставляется оператором непосредственно в интернете, и доступ к нему возможен с любого компьютера или ноутбука. 1
2. Представительский. 1 Декларация по НДС направляется через организацию, у которой уже установлен программный комплекс, позволяющий отправлять отчётность других организаций или предпринимателей. 1 Обычно такие услуги стоят дешевле, чем работа непосредственно с оператором, но не гарантируют контроль за доставкой отчётов. 1

Список лицензированных операторов ЭДО можно посмотреть на сайте ФНС. 2