Система защиты от атмосферных перенапряжений на электровозе 2ЭС5К включает грозоразрядник F1, который защищает электрооборудование цепей высшего напряжения от молний. 3

Кроме того, для снижения потенциала относительно корпуса при атмосферных перенапряжениях тяговые обмотки соединены с корпусом электровоза через конденсаторы панелей С1, С2 и конденсаторы С11–С14. 1