В официальных документах часто отступают от стандартных правил написания должностей по следующим причинам:

• Ведомственные инструкции определяют написание. 12 Использование прописной или строчной буквы в названиях должностей может устанавливаться специальными ведомственными инструкциями. 2 Например, в крупных организациях распространена практика писать наименование управлений и департаментов с большой буквы, а входящих в них структур (подразделений более низкого уровня) — с маленькой. 1
• Наименования должностей в субъектах Российской Федерации пишутся в соответствии с их конституциями (уставами). 3 Например, если слово губернатор встречается в официальном документе, стоит уточнить, с какой буквы оно пишется в уставе соответствующего субъекта Федерации. 3

Таким образом, отступление от стандартных правил может быть обусловлено конкретными нормативными документами и требованиями ведомственных актов.