Разница между фразовым глаголом run over и глаголом to run заключается в их значениях:

• Run over может означать переехать (о транспортном средстве), переполняться чувствами или эмоциями, пересмотреть или повторить что-то. 4 Например: «The unfortunate accident occurred when a car ran over the bicycle» («Несчастное происшествие произошло, когда машина переехала велосипед»). 4
• To run используется для описания процесса, когда кто-то двигается или бежит. 2 По-русски глагол to run может означать «бежать», «гнать», «убегать», «идти». 2

Таким образом, фразовый глагол run over фокусируется на конкретных действиях и состояниях, в то время как глагол to run описывает общие процессы передвижения, в том числе бег 124.