Преимущества методов секвенирования нового поколения (NGS) по сравнению с традиционными методами:

• Высокая производительность. 3 Метод позволяет рассмотреть все мутации в заданном списке генов в рамках одного исследования, давая полную картину имеющихся мутаций, что позволяет избежать дополнительного тестирования. 2
• Меньшие требования к качеству биологических образцов. 3
• Возможность всесторонне исследовать генетическую информацию всех организмов, присутствующих в образце, например, оценить бактериальный состав микробиоты кишечника, кожи или лёгких в организме человека. 3

Недостатки методов секвенирования нового поколения:

• Высокая стоимость проводимого анализа и необходимость наличия дорогостоящего оборудования. 3
• Относительно короткая длина прочтений по сравнению с традиционными методами, например, секвенированием по Сэнгеру. 4
• Большое количество ошибок секвенирования, особенно в методике нанопорового секвенирования. 14