Некоторые преимущества и недостатки разных методов секвенирования ДНК:

• Пиросеквенирование. 13 Преимущества: экономия времени, экономическая эффективность. 3 Недостатки: наличие ошибок смещения кадров, невозможность безошибочно секвенировать протяжённые участки, состоящие из одного и того же нуклеотида. 3
• Секвенирование Illumina. 1 Преимущества: высокая точность, универсальность, доступность программного обеспечения для обработки и анализа результатов, наименьшая цена получаемых данных (в расчёте на нуклеотид). 1 Недостатки: высокая цена реагентов, проблемы с секвенированием матриц с низкой сложностью, большая длительность прогона, ошибки в GC-богатых участках. 1
• Одномолекулярное секвенирование в реальном времени. 4 Преимущества: возможность получать очень длинные чтения (40 000–100 000 нуклеотидных пар), что облегчает дальнейший анализ данных и сборку геномов. 4 Недостатки: высокая стоимость прибора, сравнительно высокий уровень ошибок. 4

Выбор метода секвенирования зависит от конкретных требований и задач исследования.