Водородная связь важна для образования вторичной структуры белка, потому что она позволяет белковой структуре конформироваться таким образом, чтобы форма белковой молекулы становилась спиральной. 12

Поскольку в белковой молекуле число водородных связей очень велико (в их образование вовлечены все пептидные группы), они в сумме обеспечивают скручивание полипептидной цепи в спиральную структуру, сообщая ей компактность и стабильность. 4