Основные преимущества использования биологического мониторинга в экологических исследованиях:

• выявление более широкого круга загрязняющих веществ; 2
• возможность определить совместное действие на живые организмы различных загрязнителей; 2
• возможность оценить последствия прежних воздействий на компоненты окружающей среды; 2
• оценка мутагенности и биологической активности загрязняющих веществ; 2
• контроль интегрального воздействия всей среды на тест-организмы; 2
• определение скорости и направления неблагоприятных изменений в окружающей среде; 2
• методы биомониторинга при правильной организации эффективны с экономической точки зрения и не требуют больших затрат на приобретение аппаратуры. 2

Некоторые недостатки:

• каждая из методик предназначена для оценки веществ только по какой-либо одной биологической характеристике; 2
• требуется длительное время (от нескольких часов до нескольких суток); 2
• низкая селективность и чувствительность биотестов по сравнению с физико-химическими методами анализа; 2
• сложность при работе с живыми индикаторами, а также при их сортировке и хранении; 4
• методы дают субъективную оценку состояния окружающей среды, поскольку в большей степени характеризуют качественные показатели, чем количественные. 4