Разница между виртуальными и физическими телефонными номерами для регистрации в мессенджерах заключается в их природе и использовании:

• Виртуальный номер — это номер телефона, не привязанный к какой-либо физической SIM-карте или конкретному устройству. 4 Для работы с ним требуется интернет и специальный софт или онлайн-сервис. 24 Виртуальный номер можно использовать, например, для регистрации в сервисах, где нельзя воспользоваться своим основным номером телефона, или чтобы скрыть настоящий номер и использовать временный для приёма SMS с кодами двухфакторной аутентификации. 2
• Физический номер — это номер мобильного телефона, привязанный к конкретной SIM-карте. 14 Для регистрации в мессенджерах по российскому законодательству пользователь должен предоставить такой номер, который при необходимости позволяет идентифицировать владельца. 1

Таким образом, виртуальный номер удобен тем, что позволяет сохранять конфиденциальность и работать на разных устройствах, не привязываясь к SIM-карте, а физический номер — тем, что позволяет идентифицировать владельца и использовать его для регистрации в мессенджерах напрямую.