Разница между модификациями CRJ100 и CRJ200 заключается в установленных двигателях. 2

CRJ100 оснащён двигателями General Electric CF34-3A1, а CRJ200 — более экономичными двигателями General Electric CF34-3B1. 2 Также CRJ-200 имеет повышенные эксплуатационные характеристики: способен выполнять полёты в сложных метеорологических условиях и в условиях высокогорных аэродромов. 2

Кроме базовых моделей CRJ100 и CRJ200, существуют также модификации с увеличенной дальностью полёта: ER (Extended Range) и LR (Long Range). 3

Кроме того, специально для авиакомпаний США небольшой серией также была выпущена версия CRJ440 (CRJ200 с уменьшенным количеством пассажирских кресел до 44). 3