Основное отличие команд docker stop и docker kill при остановке контейнеров заключается в том, как они обрабатывают процесс выхода: 1

1. docker stop отправляет сигнал SIGTERM и ждёт, пока контейнер gracefully остановится. 14 Если контейнер не выходит самостоятельно в указанный период ожидания, команда отправляет сигнал SIGKILL и принудительно завершает контейнер. 1
2. docker kill немедленно отправляет сигнал SIGKILL контейнеру и прерывает выполнение его процессов. 14

Таким образом, docker stop позволяет безопасно завершить контейнер (в течение периода ожидания), а docker kill — завершить его немедленно. 3

Рекомендуется использовать docker stop, чтобы при следующем запуске контейнера не было ошибок, а docker kill — только для не отвечающих контейнеров. 1