Разница между должностями в Генеральной прокуратуре и прокуратуре субъекта РФ заключается в их структуре и назначении на должность:

• В Генеральной прокуратуре структуру составляют главные управления, управления, отделы, а также Главная военная прокуратура на правах структурного подразделения. 25 Начальники главных управлений и их заместители, начальники управлений и отделов на правах управлений являются старшими помощниками Генерального прокурора Российской Федерации. 15
• В прокуратурах субъектов РФ образуются коллегии в составе прокурора субъекта РФ (председатель), его первого заместителя и заместителей (по должности) и других прокурорских работников, назначаемых прокурором субъекта РФ. 13 Начальники управлений и отделов на правах управлений являются старшими помощниками, а их заместители и начальники отделов в составе управлений — помощниками прокуроров субъектов РФ. 13

Таким образом, в Генеральной прокуратуре должности занимают сотрудники, назначаемые Генеральным прокурором Российской Федерации, а в прокуратурах субъектов РФ — прокурором субъекта РФ и его заместителями 139.