Возможно, имелись в виду различия в обязанностях начальника и заместителя начальника отдела.

Начальник отдела определяет основные направления работы подразделения, получает векторы от вышестоящего руководства. 3 В его обязанности могут входить, например, организация оперативно-производственного планирования и диспетчирования, контроль за ходом производства и другие задачи. 1

Заместитель начальника отдела выступает проводником замыслов руководителя в коллектив и в то же время служит «обратной связью» для подчинённых. 3 Круг обязанностей заместителя начальника отдела зависит от вида такого отдела и целей его функционирования. 4

Таким образом, разница заключается в том, что начальник определяет стратегию работы, а заместитель выполняет конкретные задачи, связанные с реализацией этой стратегии.