Различия между латинизированным и кириллическим алфавитами в боснийском языке заключаются в их использовании:

• Латинский алфавит используется в повседневной жизни, преимущественно в Федерации Боснии и Герцеговины. 3 Кириллица официально признана алфавитом, но на практике она в основном применяется в Республике Сербской. 3
• Особые знаки кириллицы (љ, њ и џ) соответствуют латинским сочетаниям lj, nj и dž. 1 Таким образом, единая орфография разделяется по двум видам письма. 1
• В латинском алфавите существуют буквы q, w, x и y, которые обычно не используются в боснийском языке, но могут встречаться в именах собственных иностранного происхождения. 1 При транслитерации таких слов с латиницы в кириллицу могут возникнуть сложности. 1