Основные различия между аллостерической и ковалентной модификацией ферментов:

1. Аллостерическая модификация заключается в обратимом связывании различных метаболитов (эффекторов или модуляторов) с аллостерическим центром фермента. 12 Присоединение эффектора к регуляторной субъединице изменяет конформацию белка и, соответственно, активность каталитической субъединицы. 3
2. Ковалентная модификация заключается в обратимом присоединении или отщеплении определённой группы, благодаря чему изменяется активность фермента. 3 Чаще всего такой группой является фосфорная кислота, реже — метильные и ацетильные группы. 3

Таким образом, аллостерическая модификация регулирует активность фермента через взаимодействие с эффекторами, изменяя конформацию фермента, в то время как ковалентная модификация изменяет активность путём химической модификации самой молекулы фермента 135.