В чем заключаются основные отличия между обыкновенными и функциональными уравнениями?

Возможно, имелись в виду различия между обыкновенными и функциональными уравнениями.

Обыкновенные уравнения — это уравнения, в которых неизвестными являются числа. foxford.ru

Функциональные уравнения — это уравнения, в которых неизвестным является функция, связанная при помощи образования сложной функции с известными функциями (т. е. неизвестная функция связана с известными с помощью операции композиции). e-koncept.ru

Таким образом, основное отличие в том, что в обыкновенных уравнениях неизвестными являются числа, а в функциональных — функции.