Разница между установкой Python через менеджер пакетов и Docker заключается в подходах и возможностях установки.

Установка через менеджер пакетов (например, apt на Debian/Ubuntu, yum на CentOS/RHEL, pacman на Arch Linux) обеспечивает автоматическое обновление и управление зависимостями. 1 При таком способе установки пакеты устанавливаются напрямую в основную операционную систему. 2 Если в системе есть несколько проектов, каждый из них установит все свои зависимости вместе с другими проектами. 10

Установка с помощью Docker предполагает использование системы контейнеризации, которая позволяет запускать контейнеры приложений параллельно с другими контейнерами или приложениями, при этом код между контейнерами полностью изолирован. 10 Каждый контейнер можно рассматривать как отдельную машину с собственной операционной системой и файловой системой. 10

Таким образом, установка через менеджер пакетов подходит для ситуаций, когда нужно установить пакеты напрямую в основную систему, а установка с помощью Docker — для случаев, когда необходима изоляция зависимостей и работа с несколькими проектами, требующими разных версий пакетов. 210