Разница между ГОУ и МОУ в контексте образования заключается в статусе и учредителе образовательных учреждений:
- ГОУ — государственное образовательное учреждение, его создаёт субъект федерации. ru.wikipedia.org В большинстве случаев аббревиатуру ГОУ заменили на ГБОУ — государственное бюджетное образовательное учреждение. journal.sovcombank.ru Такие школы финансирует государство. journal.sovcombank.ru
- МОУ — муниципальное образовательное учреждение, его создают муниципальные образования. www.finexg.ru Такие школы финансируют власти города, они работают за счёт субсидий на содержание имущества и предоставление образовательных услуг. journal.sovcombank.ru
Таким образом, ГОУ относится к учреждениям, которые создаются государством, а МОУ — к учреждениям, создаваемым муниципальными образованиями.