Отличие аллостерического центра от активного центра фермента заключается в их функциях:

1. Активный центр — это уникальная комбинация аминокислотных остатков в молекуле фермента, обеспечивающая непосредственное связывание с молекулой субстрата и прямое участие в акте катализа. 15 В его состав входят аминокислотные последовательности и кофактор (у сложных энзимов). 3
2. Аллостерический центр — это участок молекулы фермента, с которым связываются определённые, обычно низкомолекулярные, вещества-эффекторы: активаторы или ингибиторы. 5 Присоединение эффектора к аллостерическому центру изменяет пространственную структуру молекулы фермента и, соответственно, конфигурацию активного центра, вызывая снижение или повышение ферментативной активности. 5