Почему в русском языке существует различие между написанием цы и ци?

Различие между написанием «цы» и «ци» в русском языке связано с лексическим и грамматическим значением слов. www.dissercat.com cyberleninka.ru

Сочетание «ци» в корне слова характеризует его как заимствованное, а сочетание «цы» — как исконно русское. www.dissercat.com cyberleninka.ru

Некоторые примеры:

• Ци: в основном употребляется в основах слова, входит в корень и/или суффикс и отвечает за лексические значения (цикорий, цивилизация, акция и т. д.). cyberleninka.ru
• Цы: в окончаниях существительных (ножницы, купцы, огурцы, саженцы), в суффиксе «ын» и окончаниях прилагательных (бледнолицый, куцый). uchi.ru

Также появлению буквосочетания «цы» способствовала твёрдость звука «ц» и отсутствие для буквосочетания «ци» морфологических ассоциаций с глагольными окончаниями. www.dissercat.com