Слова «книжка» и «книжица» имеют разные фонемы, потому что при их образовании произошло чередование согласных фонем. ebooks.grsu.by otvet.mail.ru
В слове «книжица» согласная в корне меняется с [г] на [ж] благодаря использованию суффикса -иц-. otvet.mail.ru