Некоторые ферменты работают только в присутствии определённых лигандов, потому что структура адсорбционного центра фермента определяет его субстратную специфичность. 2 Это требования фермента к молекуле химического вещества, чтобы она могла стать для него подходящим субстратом. 2
Специфичность основана на комплементарности, то есть на соответствии свойств лиганда и участка молекулы фермента, в котором связывается лиганд. 34
Например, некоторые вещества, похожие на субстрат, могут связываться с адсорбционным центром фермента, но если в их молекуле нет такой химической связи, на которую может воздействовать каталитический центр данного фермента, то химических превращений этого вещества не произойдёт. 2 Такие молекулы, занимая активный центр фермента, блокируют его работу. 2