Некоторые буквы и знаки препинания отличаются в латинской и русской версии азбуки Морзе, потому что при составлении русской азбуки Морзе учитывались начертания русских букв. 2 Например, русские буквы Е и Ё представлены одним кодом — точкой, а вместо твёрдого знака передают код мягкого знака. 2

Также некоторые буквы русского алфавита (Ш, Щ и другие) не имеют аналогов в английском языке, поэтому международная таблица расширена «русскими» вариантами. 2

Кроме того, некоторые буквы латинского алфавита имеют одинаковые напевы, что может вызывать путаницу при приёме сообщений. 1

Ещё одна причина отличий — особенности обучения: в зависимости от школы обучения или страны использования некоторые знаки могут быть изменены или упрощены. 3