Глаголы «гнать» и «гонять» относятся к разным спряжениям, хотя имеют схожий корень, из-за особенностей их неопределённой формы (инфинитива). 1

Глагол «гонять» относится к первому спряжению, так как заканчивается на «-ать» (-ять). 1 Глагол «гнать», несмотря на то, что его инфинитив также оканчивается на «-ать», относится ко второму спряжению, так как является одним из глаголов-исключений. 12

Таким образом, спряжение определяется не по корню, а по окончанию неопределённой формы: «гонять» относится к первому спряжению, а «гнать» — ко второму. 12