Ацетил-КоА считают важным энергетическим метаболитом, потому что его главная функция — доставлять атомы углерода с ацетил-группой в цикл трикарбоновых кислот, чтобы те были окислены с выделением энергии. 13

Содержание ацетил-КоА определяет направление клеточного метаболизма в данный момент: будет ли происходить синтез и накопление гликогена, жира и синтез белков или, наоборот, будут расходоваться ранее накопленные энергозапасы в организме. 2

Также ацетил-КоА является ключевой молекулой в цикле лимонной кислоты, который представляет собой серию химических реакций, происходящих в митохондриях клеток и ответственных за выработку энергии в форме АТФ. 4