Горизонтальный перенос генов у бактерий происходит несколькими путями: 35

1. Конъюгация. 15 Это процесс полового размножения бактерий, при котором две клетки соединяются белковыми мостиками и обмениваются определёнными частями ДНК. 1
2. Трансдукция. 12 Происходит из-за «болезни» бактерии, когда патогенный вирус внедряется и разрушает её клетку. 1 Вирус размножается внутри бактерии, создавая множество своих копий. 1 Иногда в новых вирусных частицах могут сохраняться обрывки ДНК погибшей бактериальной клетки. 1 Попадая в другие бактерии, такие вирусы приносят не болезни, а новые гены. 1
3. Поглощение ДНК из окружающей среды. 12 В критическом состоянии окружающей среды бактерии начинают затягивать внутрь себя различные обрывки чужеродных ДНК и встраивать их в свой геном. 1

Заимствованные гены могут быть либо добавлены к уже имеющимся у бактерии-реципиента, либо («свой» фрагмент ДНК заменяется похожим «чужим» фрагментом). 4