Формирование коралловых рифов в природе происходит следующим образом: 2

1. Береговые коралловые рифы образуются в результате поселения колониальных коралловых полипов на внешней части тектонически стабильной прибрежной отмели. 1 При отмирании организмов и цементации обломков их скелетов образуется коралловый известняк, слагающий основание кораллового рифа. 1 На этом субстрате, достигающем мощности нескольких десятков метров, располагаются живые колонии кораллов. 1
2. При тектоническом погружении берега или повышении уровня моря береговой коралловый риф постепенно преобразуется в барьерный. 1 Зона внешнего края рифа энергично надстраивается в высоту, а пространство между внешним краем коралловой постройки и берегом постепенно преобразуется в лагуну. 1
3. У берегов небольших океанических островов, испытывающих погружение, барьерные рифы со временем превращаются в кольцеобразные коралловые рифы с лагуной в середине (атоллы). 1

Для возникновения кораллового биоценоза необходимо сочетание ряда условий, связанных с температурой, солёностью, освещённостью и рядом других факторов. 3