Принцип комплементарности влияет на стабильность и функции ДНК следующим образом:

• Стабилизирует двойную спираль ДНК. 2 Водородные связи между нуклеиновыми основаниями удерживают цепи вместе и предотвращают пространственные искажения. 2
• Способствует точности репликации. 3 Комплементарность нитей ДНК в двойной спирали позволяет использовать одну нить в качестве шаблона для построения другой, что обеспечивает передачу генетической информации следующему поколению. 2
• Помогает в репарации ДНК. 23 Механизмы репарации, основанные на комплементарности, позволяют исправлять ошибки во время репликации ДНК путём удаления несовпадающих нуклеиновых оснований. 2
• Участвует в передаче генетической информации. 4 ДНК выступает матрицей в процессе передачи генетической информации из ядра в цитоплазму к месту синтеза белка. 4 При этом на одной из её цепей по принципу комплементарности синтезируется молекула информационной РНК. 4