Пептидазы участвуют в регуляции множества биологических процессов через различные механизмы, например:

• Регуляция локализации и активности белков. 1 Пептидазы определяют время жизни других белков, играющих важную физиологическую роль, таких как гормоны, антитела или другие ферменты. 2
• Изменение белок-белковых взаимодействий. 1 Это влияет на репликацию ДНК и транскрипцию, клеточную пролиферацию и дифференциацию, морфогенез тканей. 1
• Генерация, передача и усиление молекулярных сигналов. 1 Пептидазы запускают внутриклеточные каскады реакций, что лежит в основе клеточной дифференцировки и трансформации, адаптивной перестройки обмена. 3
• Влияние на время жизни пептидных фрагментов. 4 Путем активизации пептидаз в нужном месте и в нужное время образуется необходимое количество коротких пептидных фрагментов, обладающих более высокой биологической активностью, чем исходные соединения. 4

Также пептидазы участвуют в переваривании проглоченных белков, катаболизме белков (расщеплении старых белков) и передаче сигналов в клетках. 2