Как можно определить вид дикорастущего гриба по ДНК?

Для определения вида дикорастущего гриба по ДНК используют метод ДНК-штрихкодирования. elementy.ru Он основан на том, что каждый вид можно однозначно идентифицировать по сравнительно небольшому фрагменту генома. elementy.ru

Процесс включает несколько этапов: sciencejournals.ru

1. Получение последовательности ДНК от неидентифицированного образца. sciencejournals.ru Сравниваемую последовательность сравнивают с референсной библиотекой, которая составлена из последовательностей типовых образцов всех видов рода. sciencejournals.ru
2. Определение, к какому виду относится образец. sciencejournals.ru Если он ближе к одному виду (одна замена), чем к остальным (10–20 замен), то образец определяют до вида. sciencejournals.ru Если нет (например, от одного вида он отличается пятью заменами, а от другого — шестью), то заключают, что, возможно, обнаружили новый вид. sciencejournals.ru

Для идентификации грибов также используют ген 18S-рРНК, который находится в малой субъединице рРНК грибов. elib.sfu-kras.ru Он несёт как консервативные, так и вариабельные участки нуклеотидной последовательности, что позволяет использовать его для определения рода и видовой идентификации микроорганизмов. elib.sfu-kras.ru

Точная идентификация грибов — сложная задача, так как некоторые из них известны только по вегетативным структурам, что делает традиционные подходы к классификации практически невозможными. imafungus.biomedcentral.com