Гомозиготность влияет на фенотипические признаки организмов следующим образом: для гомозиготных особей выраженный признак определяется исключительно присутствующими аллелями. 1

Например, у гомозиготных доминантных особей будет очевиден доминантный признак, а у гомозиготных рецессивных — рецессивный. 1 Если организм гомозиготен по рецессивному гену, то есть доминантный аллель отсутствует, то фенотип будет в соответствии с рецессивными признаками. 2

Также при скрещивании гомозиготных особей, отличающихся по одной паре альтернативных признаков, всё потомство первого поколения единообразно как по фенотипу, так и по генотипу. 5