Гомозиготность важна для чистоты генетических признаков, потому что гомозиготные особи не дают расщепления в следующем поколении. 2 Они сохраняют свои признаки в «чистом» виде. 3

Это следует из первого закона Менделя: при скрещивании двух гомозиготных организмов, относящихся к чистым линиям и отличающихся друг от друга одной парой альтернативных проявлений определённого признака, первое поколение гибридов будет одинаковым и будет нести проявление признака лишь одного из родителей. 4

Также гомозиготное разведение способствует сохранению чистоты определённых признаков в последующих поколениях. 1 Например, в животноводстве применение инбридинга способствует концентрации наследственных задатков, в результате чего получают животных, гомозиготных по ряду признаков, что позволяет быстро закреплять ценные свойства и создавать однородное поголовье. 3