Makefile для Python-проектов и для C/C++-проектов может отличаться по целям использования.

Для C/C++-проектов Makefile обычно применяется для компиляции файлов кода. 1 Цель инструмента — компилировать только те файлы, которые нужно перекомпилировать, основываясь на отслеживании изменения файлов. 1

Для Python-проектов Makefile может использоваться для автоматизации различных задач и оптимизации процесса разработки. 3 Несмотря на то, что Python не требует компиляции, Makefile позволяет, например, управлять зависимостями, запускать тесты, строить документацию, форматировать код и так далее. 3

Таким образом, основное отличие в том, что для C/C++-проектов Makefile в первую очередь предназначен для компиляции, а для Python-проектов — для решения более широкого спектра задач.