Дизайн персонажей «Черепашек-ниндзя» изменялся в разных версиях комиксов, например:

• Первая версия от Mirage Comics. 2 У персонажей не было ярких отличительных черт, даже повязки были одного цвета. 2 Эта версия стала основой для большинства последующих дизайнов. 2
• Мультсериал 1987 года. 23 Для него студия Murakami-Wolf-Swenson решила сделать больше внешних отличий между братьями. 3 Например, сделать эмблемы на поясах с первой буквой имени конкретного брата. 3 Также был выбран разный цвет повязок, что стало стандартом для образов. 3 В отличие от первоисточника, в мультсериале у черепах отсутствовали хвосты. 3
• Серия комиксов от Image Comics. 1 В 1996 году издательство выкупило права на публикацию основной серии и вернуло чёрно-белый рисунок. 1 При этом экшена стало больше, а сюжет развивался быстрее. 1
• Мультсериал 2003 года. 2 В этой версии черепахи вернулись к своим корням в дизайне персонажей. 2 Вместо мягких округлых тел серии 1987 года, здесь черепахи стали более громоздкими и мускулистыми. 2 У них сохранились цветные повязки, но исчезли зрачки и округлые глаза, вернулся угловатый, устрашающий вид прошлого. 2
• Серия комиксов от Nickelodeon. 3 В этой версии у черепах стало больше индивидуальных черт: рост, цвет глаз, родинки, царапины, атрибутика и мышечная масса. 3

Кроме того, художники, работавшие над изображениями Черепашек, подходили к этому по-разному: Джим Лоусон рисовал персонажей мускулистыми и угловатыми, а Кен Митчрони, наоборот, «размягчал» своих героев и придавал им дурашливые гримасы. 5