Некоторые ключевые отличия в порядке уплаты НДС в ФТС и налоговую службу:

1. При импорте из стран, не входящих в ЕАЭС, НДС уплачивается на таможне одновременно с другими таможенными платежами до завершения процедуры выпуска товара с таможенного поста. 4 Платеж совершается в адрес таможни, а не поста. 4
2. При импорте из стран ЕАЭС НДС уплачивается в налоговую службу, где зарегистрирована компания. 1 Это нужно сделать не позднее 20-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором приняли товар на учёт. 1 До этого же числа подаётся декларация по импортному НДС. 1

Кроме того, базы для начисления налога для входящих и не входящих в состав ЕАЭС стран определяются по-разному: в первом случае ей служит стоимость, отражаемая в товаросопроводительных документах (плюс акциз, если он есть), а во втором — таможенная стоимость, увеличенная на таможенную пошлину и акциз (если пошлина и акциз должны уплачиваться). 3