Роль Федерального казначейства в системе государственного финансового контроля заключается в следующем:

• Обеспечение исполнения госбюджета и государственных программ. 1 Ведомство контролирует, насколько корректно используются средства бюджета РФ, субсидии, субвенции, кредиты. 1
• Применение мер по устранению нарушений законов, регламентирующих пользование бюджетными средствами. 1
• Принятие превентивных мер в отношении лиц, способных нарушать законодательство в области управления бюджетными средствами. 1

Кроме того, Федеральное казначейство регулирует финансовые отношения между бюджетом федерального уровня и государственными внебюджетными фондами, исполняет бюджеты таких фондов, контролирует формирование и расходование их финансовых ресурсов. 3

Также ведомство консолидирует, обрабатывает и анализирует сведения о состоянии государственных финансов, представляет высшим органам государственной власти отчётность об операциях Правительства по федеральному бюджету. 3