В озере Титикака обитают около 58 различных видов рыб. 5

Аборигенная ихтиофауна представлена карпозубообразными рыбами рода орестиас (Orestias, указывается около 20 видов) и сомами рода Trichomycteris (2 вида: T. rivulatus и T. dispar). 2

Среди инвазивных видов в озере встречаются, например:

• Форель (озерная форель и радужная форель). 3 Североамериканская рыба была завезена в озеро Титикака в 1930-х годах. 1
• Аргентинский сильверсайд. 1 Рыба была завезена в озеро в 1950-х годах. 1

Также в глубинах озера встречаются морские рыбы, включая акул и ракообразных. 4