Разница между доступом к файлам с использованием MANAGEEXTERNALSTORAGE и доступом к медиафайлам через MediaStore заключается в том, что каждый из этих подходов имеет свои особенности.

Доступ к файлам с использованием MANAGEEXTERNALSTORAGE позволяет приложениям читать и писать все файлы в общем хранилище, а также получать доступ к корневой директории USB-диска и SD-карты. 3 Это разрешение необходимо, например, для резервного копирования и восстановления, защиты от вирусов, управления документами. 1

Доступ к медиафайлам через MediaStore API позволяет приложениям просматривать медиафайлы на внешнем накопителе и взаимодействовать с ними, не запрашивая доступ ко всем файлам. 12 В этом случае пользователи могут без труда извлекать и обновлять медиафайлы, которые остаются на внешнем накопителе устройства даже после удаления приложения. 1