Да, компьютер сможет увидеть SSD с GPT и два HDD с MBR одновременно. 12 Операционная система не делает различий между этими разметками на разных физических дисках. 1
Однако загрузочный диск по разметке должен соответствовать способу загрузки (UEFI — GPT, BIOS/LEGACY — MBR), а остальные могут быть в любой разметке. 1