Основные отличия PCI Express 2.0 от 3.0:

• Кодирование. 1 В PCI Express 3.0 используется схема 128b/130b, а в 2.0 — 8b/10b. 14 Это означает, что PCIe 3.0 более эффективен, так как передаёт больше данных в секунду. 1
• Пропускная способность. 14 У PCI Express 3.0 она увеличена вдвое по сравнению со стандартом 2.0. 24
• Скорость передачи данных. 14 Максимальная скорость для PCIe 3.0 — 8 GT/s, а для 2.0 — 5 GT/s. 1

При этом сохранилась полная совместимость с предыдущими версиями PCI Express: карты PCI Express 1.x и 2.x будут работать в разъёме 3.0, и наоборот. 2