Возможно, имелись в виду различия между дубликатом сертификата электронной подписи и новым сертификатом, выданным удостоверяющим центром (УЦ).

Дубликат сертификата не отличается от оригинала. 12 Он имеет такой же номер и срок действия. 12 Дубликат можно сделать, например, в случае потери токена, на котором хранится электронная подпись. 1

Новый сертификат, выданный УЦ, может иметь особенности, например, сертификат от ФНС нельзя копировать и делать дубликат для сотрудников. 5 Такой сертификат можно получить только при личном визите в УЦ налоговой и её представителей. 5

Ещё есть информация, что не все ключи электронной подписи можно копировать. 1 Некоторые системы и ведомства запрещают это делать, например, ФНС и ЕГАИС. 1 Владельцу таких ключей в случае их удаления или потери придётся идти за новыми. 1