Написание слова «подлинный» с двумя буквами «н» объясняется этимологической связью этого прилагательного со словами «длина», «длинный». 3
В древности слово «подлинный» было образовано с помощью этимологической приставки «по-» и суффикса «-н-»: длина — длинный — подлинный. 3 В результате на стыке корня, заканчивающегося буквой «н», встретился такой же суффикс, и слово приобрело двойное написание «нн». 1
В современном языке в морфемном составе слова «подлинный» не выделяется этимологическая приставка и суффикс. 3