Чем отличается режим работы Главной военной прокуратуры от гражданских прокуратур?

Возможно, имелись в виду различия в графике работы Главной военной прокуратуры и, например, прокуратуры города Москвы.

Главная военная прокуратура работает по следующему графику: www.moscowmap.ru {9-host}

• Понедельник, вторник, среда, четверг — 09:00–18:00, перерыв 13:00–14:00. www.moscowmap.ru {9-host}
• Пятница — 09:00–16:45, перерыв 13:00–14:00. www.moscowmap.ru {9-host}
• Суббота и воскресенье — выходные. www.moscowmap.ru {7-host}

Прокуратура города Москвы имеет такой график работы: www.moscowmap.ru

• Понедельник, вторник, среда, четверг — 09:00–18:00, перерыв 13:00–14:00. www.moscowmap.ru
• Пятница — 09:00–16:45, перерыв 13:00–14:00. www.moscowmap.ru
• Суббота и воскресенье — выходные. www.moscowmap.ru

Таким образом, график работы Главной военной прокуратуры отличается от графика работы прокуратуры города Москвы: у Главной военной прокуратуры есть выходные в субботу и воскресенье, в то время как у прокуратуры города Москвы они не предусмотрены.