Различия между ATP-зависимыми и NAD-зависимыми ДНК-лигазами заключаются в используемом кофакторе. 13
ATP-зависимые ДНК-лигазы найдены в бактериофагах, археях, эукариотах и эукариотических вирусах. 1 NAD-зависимые ДНК-лигазы встречаются в основном у бактерий. 1
При этом некоторые лигазы гипертермофильных архей могут использовать и АТФ, и НАД+ в качестве кофактора. 1
Также ATP- и NAD-зависимые ДНК-лигазы обладают низкой гомологией аминокислотных последовательностей, но имеют общее каталитическое ядро. 1
Таким образом, основное различие заключается в том, что ATP-зависимые лигазы распространены в разных группах организмов, в то время как NAD-зависимые встречаются преимущественно у бактерий.