Преимущества методов возмущения Меллера-Плессе перед другими методами квантовой химии заключаются в следующем:

• Простота применения. 2 С точки зрения пользователя обращение к методам теории возмущений не намного сложнее, чем к обычной процедуре Хартри-Фока. 2
• Повышение точности расчёта. 1 Теория возмущений Меллера-Плессета второго порядка (MP2) значительно повышает точность расчёта по сравнению с методом HF. 1
• Возможность расчёта слабосвязанных комплексов и малых молекул. 1 Для этих целей MP2 даёт чуть более высокую точность, чем DFT. 1

Однако у метода MP2 высокие вычислительные затраты, поэтому его не рекомендуется использовать для расчёта молекул среднего и большого размера. 1