Преимущества аксиоматического метода в науке:

• Возможность полностью раскрыть логическую структуру различных теорий. 2 Особенно это касается математических теорий. 2
• Возможность лучше контролировать ход рассуждений, добиваясь необходимой логической строгости. 2
• Метод исследования новых закономерностей, установления связей между понятиями и теориями, которые раньше казались обособленными друг от друга. 2
• Помощь в науках, в которых первоочерёдными являются эксперименты и наблюдения, так как аксиоматический метод помогает соотнести полученные данные между собой, провести их анализ, определить взаимосвязи. 3

Недостатки аксиоматического метода:

• Невозможность создать гипотезы, использовать интуицию, геометрические интерпретации, индукционные предположения и другие наглядные подсказки рассуждений в доказательствах. 3
• Не всегда возможно найти исходный набор аксиом, полностью описывающий рассматриваемое явление или объект. 4