Преимущества различных методов микроскопии при изучении простейших организмов:

• Световая (оптическая) микроскопия. 1 Позволяет изучать морфологию, размеры и взаимное расположение клеток, их структурную организацию и другие особенности. 2 Однако волновая природа света накладывает ограничение на минимальный размер объектов, которые можно изучать (они не должны быть меньше длины волны света). 2
• Фазово-контрастная и интерференционная микроскопия. 1 Позволяют визуализировать фазу света, что даёт возможность видеть тонкие детали в живых объектах без фиксации и окрашивания. 1
• Флуоресцентная микроскопия. 1 Используется для изучения образцов с собственной флуоресценцией, а также для образцов, окрашенных определёнными флуоресцентными красителями или меченными ими антителами. 1
• Электронная микроскопия. 14 Даёт большее разрешение, чем световой микроскоп, и позволяет изучать не только морфологию и строение клеток, но и внутриклеточных органелл и даже молекул. 4

Недостатки:

• Классическая оптическая микроскопия имеет низкую разрешающую способность (максимальное увеличение до 2000 раз), что не позволяет изучать белковые соединения и различные молекулы, вирусы и другие объекты. 4 При рассмотрении объектов с высоким увеличением возникает искажение и дисторсия (неравномерное увеличение частей целого). 4
• Подготовка препаратов для электронной микроскопии сложна: их фиксируют, обезвоживают, заливают в плотную среду, делают тончайшие срезы. 1 Также обязательно окрашивание или напыление, как правило, солями тяжёлых металлов, так как только они существенно задерживают поток электронов. 1